冬末初春，正是防治果树病害的关键时期，同其他果树一样，杏树也容易受到虫害和病害的危害，造成树体衰弱，甚至死亡，影响果实的产量和质量，使经济效益下降。杏树的主要病害有流胶病、黑星病、疮痂病、炭疽病等，它们在不同年份时有发生，对生产造成危害，必须及时防治。
根腐病是细菌性病害，通过雨水和土壤传播，主要发生在杏树苗圃地。病菌从土壤侵入须根，发病初期染病须根出现棕褐色圆形小斑，以后病斑扩大连成片，并传染到主根和侧根上，开始腐烂。
防治该病需注意，严禁在重茬地育苗或建园；在苗木栽植前，进行苗木消毒；加强肥水管理，增强树势，提高树体抗病能力。发现病株，用200倍硫酸铜溶液或200倍代森锰锌溶液进行灌根处理。
流胶病主要发生在枝干和果实上，在树干的伤口裂缝处流出黄褐色透明的树胶，流胶处的木质部变褐、腐烂。流胶严重的树体，叶片变黄，树势衰弱甚至整株枯死。果实受害时，从果核流出的胶体渗出果面，使果肉发硬，不能食用。
防治该病可通过重施有机肥，同时树盘覆草，这样可以改良土壤，增强树势，来提高树体抗病能力。还要合理修剪，修剪时尽量不要在枝干上造成很大的伤口；加强夏季修剪，保持树体通风透光，减少无效生长，同时也避免冬季疏除量过大造成伤口过多。及时防治蛀干害虫，减少伤口，防止流胶。最后在杏树生长季节要及时喷药防治，每10~15天喷施1次50%超微多菌灵可湿性粉剂600倍液，或72%杜邦克露可湿性粉剂800~1000倍液，或50%苯菌灵可湿性粉剂1200~1600倍液。
黑星病是由真菌引起的病害，主要危害果实，也危害枝叶。危害果实时，在果实的肩部出现近圆形的暗绿色小斑点，随着果实的增大，斑点扩大，颜色变成褐色，严重时病斑连片。危害枝叶片时，黑褐色病斑连成片，致使叶片穿孔，导致早期落叶，严重时枝梢枯死。
该病要加强田间管理，保持树体通风透光，提高树体抗病能力。杏树落叶后彻底清除梨园中的枝、落叶、病果，集中烧毁或深埋；冬季结合修剪清除病枝，并集中烧毁，减少病菌来源。在杏树落花后，及时喷杀菌剂，杀菌剂主要有石硫合剂、波尔多液、退菌特、烯唑醇、甲基托布津、代森锰锌等，根据剂量和说明配置适宜的浓度，交替使用。
杏疔病也是由真菌引起的病害，主要危害叶片、新梢，有时也危害花和果实，是北方杏产区的重要病害。叶片染病后，叶片由绿色变成黄色，后成红褐色，厚度增加，叶质硬脆。病叶到后期干枯，挂在树上不易脱落。新梢染病后，生长缓慢，节间粗而短，病枝的叶片上有黄褐色突起的小粒点。
对该病的防治，需要加强田间管理，结合修剪清除病枝落叶，并集中烧毁，消灭越冬病菌是防治杏疔病的主要措施。花芽萌动前，结合防治其他病虫，喷5波美度石硫合剂；展叶后再喷0.3波美度石硫合剂或喷1~2次11.5∶200的波尔多液，可达到防治的目的。
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